天正13年（1585年）、阿蘇氏征討の総大将となった島津義弘の侵攻を受け、阿蘇氏重臣で長野城主の長野惟久は南郷城に入って徹底抗戦の末に討死したと伝わる。城主を失った長野城もまた島津方の手に落ち、阿蘇領は平定された。