足立区入谷に位置する真言宗豊山派の寺院。入谷の農村集落に根ざし、南方の光明・仏の慈悲を示す「南光」の寺号のもと先祖供養と開運のご利益で知られる。

創建年代は不詳。天文12年（1543）に没した良賢師が中興したと伝わる。『新編武蔵風土記稿』には弘安3年（1290）4月20日「圓祐」の記載が最古の記録として見える。山号は青龍山、寺号は医王院南光寺。本尊は不動明王で、薬師如来も併せ祀ることから「医王院」の名を持つ。真言宗豊山派で円通寺の末寺。安政3年（1856）の火災で過去帳など記録が全て焼失し、慶応3年（1867）に円通寺住職・真明が記録を再興した。