永正2年（1505年）、京極高清が上平寺に築いた居館と詰城が起源。大永3年（1523年）の家臣反乱で京極氏は没落し、浅井氏が北近江の実権を握った。元亀元年（1570年）、朝倉攻めで信長を裏切った浅井長政は上平寺城を改修して織田氏への防衛線としたが、鎌刃城主・堀秀村の寝返りにより破られた。